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[要有爱] 用空闲时的显卡参与Folding@home蛋白质折叠计算-早日攻克癌症等人类疾病

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发表于 2008-12-30 00:46:50 | 显示全部楼层 |阅读模式
为了在废土到来之前早日攻克癌症。。。。。。。
好把 借用废土宝地宣传一下。。。

这个项目就是和著名的BOINC 和SETI@home 同一个类型的分布计算项目

(如果不打算看完觉得实在太长篇累牍的话 也放出ZOL的一个链接 这个是zol自己做的一个宣传 http://vga.zol.com.cn/109/1093216.html

http://vga.zol.com.cn/109/1093216.html )

如果你有一块独立显卡,那么在您没玩3D游戏的其他时间内(比如上网、看高清视频、玩联众、边锋、QQ游戏、人离开电脑时)都可以利用显卡闲置的GPU强大的浮点和并行计算能力参与斯坦福大学的这个全球医学类分布式计算项目Folding@home(以下简称FAH),为人类早日攻克诸如癌症、疯牛病(Mad Cow, BSE),帕金森氏症(Parkinson's),肌萎缩性脊髓侧索硬化症(ALS),可传播性海绵状脑病(CJD),阿兹海默症 (Alzheimer's)等诸多综合疾病尽一份绵薄之力。



早在2003年初国内就有很多爱心人士用电脑的CPU参与这个项目的计算,也涌现了许多参与这个项目的团队,其中最大的团队(现在的国家队)就是China Folding@home Power(团队编号为 3213),并于05年进入FAH计算项目团队排名世界五十强。

到了06年10月FAH提供了对基于ATI显卡的GPGPU并行计算的支持,随着日后大量的ATI显卡和PS3游戏机用户的加入,使得FAH分布计算的客户端运算速度和计算结果提交量成几何倍数上涨;受限于国内用户经济条件和对FAH认知度的差距,我们的3213国家队内GPU数量相对大大落后于国外其他团队,也使得我们团队的排名跌到了世界130名开外,同时也由于GPU计算的高效快速也使得大量的使用CPU计算的爱心人士默默淡出了FAH项目计算, China Folding@Home Power 团队也进入了一个相对沉闷的阶段。

08年6月NVIDIA统一架构显卡基于 CUDA的通用计算首先应用在FAH计算上,基于GPU近乎变态的双精度浮点运算和并行计算能力,再加上FAH新的客户端对CUDA的完美支持,使得 NVIDIA显卡的FAH计算能力后来居上,大大超越了基于ATI显卡的GPGPU,N卡和A卡及PS3的用户大量参与直接的结果就是大大提高了FAH的总运算速度,使得人类攻克癌症等疾病日期变得指日可待!

今年7月以来随着FAH客户端对N卡的支持,China Folding@Home Power 也进入了相对活跃的时期,国内很多使用8XXX/9XXX/2XX的N卡2XXX/3XXX/4XXX的A卡的爱心人士纷纷加入3213团队的FAH计算,这其中以用户名 ZXY0714 的兄弟为代表,他自费购置多块8800ULTRA、9800GTX2、GTX280等高端显卡组成一个“飙分农场”,动手汉化了FAH计算程序的客户端,被誉为3213的大地主,日均计算得分50000+,占了3213团队日均得分17万的近1/3,在他的带动下加上团队内所有弟兄们的努力使得3213团队的总分迅速增长到2700多万,国家排名提升至现在91名。

但是我们不得不承认差距,做为国家队的91排名的确不高,甚至比国外很多民间团队的排名还低很多,相比参与者较多的西方国家,我们的总贡献只相当于澳大利亚几支队伍中最大的团队的1/37,相当于俄罗斯几支队伍中的最大团队的1/14,不能不令我们这个世界上电脑保有量名列前茅国家的所有FAHer们汗颜!

差距就是动力!海峡对岸的台湾FAHer们首先行动起来了,台湾目前最大的三个团队:苍者极限论坛coolaler.com Taiwan团队、PCDVD的团队以及Taiwan team团队, 在PCDVD领军人物RazielHCC的提议下集体合并到了Taiwan team,(此人还自费购置多块8800GTS显卡无偿提供给团队内的队友计算FAH之用,条件只有一个:免费得卡人一年内必须贡献给团队150万分,令人敬佩),三队合一后的Taiwan team目前以3.5倍于我们3213国家队的日均计算能力奋起直追,他们日平均获得分数在世界排行前20左右

兄弟姐妹们,我们该怎么办?我们能无视差距么?我们甘于落后么?在现今我们有足够计算能力的前提下我们是不是应该更强大一些?我们能无视台湾省队超越国家队的现实么?如果不能,那么请尽快加入我们吧――让我们一块FAH !

(能认真看到这里,不管日后您是否参与FAH项目我们都感谢你-因为通过这篇草文您了解了我们3213团队和我们每个队员为FAH项目所做的努力!如果您为我们的所作所为而有所触动那么请您把我们这篇草文在您熟悉的网站或者论坛上转载,我们表示由衷的感谢!如果您是爱心人士,也想与我们一道参与 Folding@home计算项目,可以登录中国分布式计算论坛的 Folding@home 子论坛网址 http://www.equn.com/forum/forum-21-1.html

http://www.equn.com/forum/forum-21-1.html 了解详情,我们表示热烈的欢迎!)


言归正传,下面是斯坦福大学Folding@home项目主页上的简介:
官方中文主页http://folding.stanford.edu/Chinese/Main

http://folding.stanford.edu/Chinese/Main


http://folding.stanford.edu/English/Main
我们的目标是:了解蛋白质折叠,折叠错误,与相关疾病的关系
什么是蛋白质折叠, 蛋白质折叠又是怎样联系到疾病的呢?
蛋白质是一个生物体系的动力和纳米机器。在蛋白质实现它的生物功能之前,它们会把自己装配起来,或者说是折叠;虽然蛋白质折叠是对所有的生物体系来说最重要的和最基本的过程,但这个过程对人类而言仍然是个未解之谜。此外,当蛋白质没有正确的折叠(折叠错误)会导致严重的后果,包括许多知名的疾病,比方阿兹海默症(Alzheimer's),疯牛病(Mad Cow, BSE),可传播性海绵状脑病(CJD),肌萎缩性脊髓侧索硬化症(ALS),帕金森氏症(Parkinson's),和其他多种癌症及其相关得综合病症。
您仅仅需要通过运行一个程序就可以帮助我们
Folding@home是一个分布式计算的项目 —从世界各地来的人下载运行我们的客户端程序,彼此组合在一起构成了世界上最大的超级计算机之一。每一台参与的计算机都使我们的项目更接近成功一步。Folding@home把分布式运算和革新的计算方法有机的结合在一起,使我们能解决比以前碰到的困难无数倍的问题。


如果你想和我们一起参与FAH计算,首先你需要下载一个FAH基于显卡GPU运算的windows:V6 GPU2客户端程序(目前最新版本6.23版,支持A卡的2xxx/3xxx/4xxx和 N卡的8xxx/9xxx/2xx系列显卡,配合FAH专用驱动180.70版本支持8xxx/9xxx/2xx全系列显卡
在此我建议ATI的用户,使用催化剂8.12的驱动,对H4XXX系列显卡的运算能力最多有30%的提升 而NV显卡用户,最好用G8X或者G9X核心(甚至是最新的GTX200系列)显卡进行运算,因为支持CUDA的显卡运算速度很快
官方下载页面http://folding.stanford.edu/English/DownloadWinOther

安装完毕后进行运行程序并进行几个必要的设置:
首先在右键点击屏幕右下角任务栏的FAH图标,在弹出的菜单里左键点击Configure(设置),弹出对话框的USER用户界面填入您喜欢的用户名,在team number(团队编号)内填写国家队的编号3213;如图所示



再点击弹出对话框上的connection(网络连接)把能接受10M大数据包的钩勾上(能获得高分值的数据包),其余建议空着,如图所示




再次点击弹出对话框上的advanced(高级设置)里把运算优先度的点击到稍微偏高,把CPU使用率(注意:实际上是显卡GPU的使用率)滑条拉到最右侧 (FAH程序能智能探测你电脑当前程序使用GPU的情况,当有3D程序运行时FAH会自动降低或停止FAH的运算,一点不会影响你当前的操作,你可以一边玩2D游戏或者看高清电影一边开足马力算FAH,其他诸如浏览网页等操作更不在话下),最后别忘记把磁盘记录点频率滑条拉到最左侧的3分钟存盘一次(避免意外关机或重启电脑时你的FAH计算数据丢失)。如图所示



最后千万别忘记点击对话框的确定按钮,保存当前设置!

好了,到此为止您就是3213国家队一员了,计算过程根据一个数据包的大小和不同的显卡的浮点运算能力有时间长短,一般在十几分钟到十几小时不等,计算完毕后FAH程序会自动将您的计算结果通过网络连接上传到斯坦福大学的专用服务器上(如果您装有防火墙,请确定允许FAH程序下载和上传数据时使用网络通过防火墙),计算结果经验证正确后您的用户名会得到的分数,反映了您的显卡作出的贡献大小,你可以点击上图所示的用户界面内的相关按钮查询自己的或3213 团队的得分情况以及您所有运算任务的完成情况。

下面是A卡和N卡运行FAH的界面截图(不建议打开,会消耗额外的显卡资源,降低显卡运算FAH的速度)




如果您电脑里安装有两块显卡,您可以同时运行两个FAH客户端程序(如何设置使用请登录我们的论坛查看相关帖子http://www.equn.com/forum/forumdisplay.php?fid=21
http://www.equn.com/forum/forumdisplay.php?fid=21 ) ,获得更高的计算能力和得分,最后注意同一IP地址同一用户名下的显卡的机器ID不能重复(最多支持编号0-16的17块显卡)如上图的高级设置截图。

参加FAH完全是自愿的献爱心行动,短时间内你除了看到不断增长的积分以外可能得不到任何报酬或者官方表扬,您还要额外多付出少许电费,但等到人类完全战胜癌症等疾病时你会感到自豪,而那些因您参与的FAH而治愈的患者和家属们从心底感激您的――尽管他们可能不知道您是谁。个人认为参加FAH比信佛念经拜菩萨或者信上帝来的更实际有效一些。


参加FAH贵在持久的坚持,是热情加素质再加耐心的献爱心公益活动,祝您在FAH的同时享受奉献的快感!

为了尊重原作者金鹏的劳动成果,这里也顺便给出原帖的地址 我只是加以修改和转载
http://group.zol.com.cn/11/6_108444.html

现在解答一下大家即将会问到的一些问题 也是我们一直在宣传过程中遇到的问题

首先,要说的,这个东西完全是一个“损己利人”的东西,你所消耗的是你宝贵的RMB(电费)还要损耗着你的硬件,因为长期高负载工作,而你获得的几乎是零。没有人会记得你曾经干了啥,即使人类真的攻克了癌症或者其他疾病也几乎不是你做的贡献,因为个人的贡献值有限。也不是说你搞了这个分布计算,癌症就会马上被攻克,因为,我们所做的只是很基础的东西,只是把蛋白质的折叠模拟了一次,之后的分析和实验还要由其他国家的科学家去继续研究,最后还不一定有啥成果。

然后可能很多同学会问,这个是不是“给外国做贡献”。其实如果国内有这么一个项目的话我更加愿意去参加,只是奈何我们没有这个分布计算项目,而且我相信医疗的发展是全人类都受惠的,如果非得说我们的贡献全部给外国抢走了,那么只要你看看全世界还有那么多傻子和你一样在搞这个东西,(再一次强调这个计划是美国斯坦福大学发起的),不单美国人在搞,越南澳洲日本等很多都有属于自己的国家队,那么你也应该“释然一点”了吧。

再者,其实有些人真是“很无聊”,你很难想象,在我们队里面现在排行第一的那个朋友,他自己拥有 9800GX2- 3WAY(3路SLI) GTX280 -3WAY 8800U 这些顶级显卡,几乎不玩游戏,全力算Folding@home,他一天获得的分数比我一个月的总获得分数还要高,有时候真是有些人不知道是为了什么的,所谓的无欲无求?还是说回馈社会?而我自己是因为有至亲的人和朋友的亲戚曾经患有癌症,最后都很幸运地康复。所以更加让我明白到癌症等其他一系列不治之症的可怕,我不是学生物或者医学的,所以我没有办法在专业上做出什么贡献,我唯一能做的,就是尽自己微薄的力量,参加到这个分布计算去,“聊以自慰”。

如果你是一个有爱的人,又是一个有能力参加到这个项目的人,我们都欢迎你的加入

我们的论坛是 http://www.equn.com/forum/forum-21-1.html
这里会有很多志同道合的朋友 也有很多热心的朋友为你一一解答你想了解的问题

友情提示:请在运行3D程序,特别是游戏的时候,千万不要运行次软件,会把你卡得嘎吱嘎吱响

按照往常经验,平均100人以上看到这个才会有1个考虑加入(有条件情况下),所以大家并不需要担心这个会导致能源危机,整个中国队活跃的队员也大概200人多点(曾经高峰时期是400个左右),我们是很小众的。
队伍里面的疯狂人物ZX0714是正常人都没办法比的,2个3路SLI的机器都是配备1000W的电源,几乎24小时开着(那个电费很可怕,不要去想了)
况且,真的是有条件下才考虑参与,这个项目是希望能有持之以恒的人参加到来,其实大家当是看看也好,能有更加多人了解到这个项目,我就很心满意足了。

参加到这个项目上的朋友原则上,本质宗旨上是以自愿和利用空闲资源为原则,有时上网或者下载东西或者QQ聊天的时候都是空闲着你的显卡资源的,就可以进行这个运算。只有有心就可以完成,另外显卡的“任务包”3天就会过期,所以一定要保证3天内一定要计算完一个任务要不就白费心机了

其实我不是嫌弃使用笔记本电脑的朋友,但是如果长期用这个折腾笔记本电脑的话,会减少你笔记本电脑的寿命。因为笔记本电脑的散热是很大问题,这个一定要预先说明给大家听。其次如果显卡不好的朋友可以使用CPU版,最好你的CPU是双核或者以上级别。我们队伍里面排行第2人称水鬼的朋友,就是一直用CPU来作为计算媒介,全部都是用服务器的CPU!从以前的2路单核到现在的2路四核甚至4路四核的服务器都给他拿来用了=.=

中国分布计算总站的地址是
http://www.equn.com/index.php/%E9%A6%96%E9%A1%B5
这里还有很多不同的分布计算项目,Folding@home只是其中的一个。如果有兴趣可以来了解一下

针对某些朋友的问题作一点回复

关于汉化版 群组里面有人做了汉化版
下载地址为 http://www.rayfile.com/files/86f ... -aae1-0014221b798a/
需要原版客户端的支持 详细用法请看文件的TXT说明文档


关于开机如何自动启动这个程序

只要把FOLDING@HOME的快捷方式复制到 C:\Documents and Settings\Administrator\「开始」菜单\程序\启动 这个目录下面

就可以开机自动启动了

这个地址是可以让大家看到大家在队伍里面的排名情况 该服务器4小时更新一次 估计你第一次上交结果后4小时之内就可以看到你的名字了
http://folding.extremeoverclocki ... p?s=&t=3213
发表于 2008-12-30 00:52:12 | 显示全部楼层
跟这个类似的还有那个找外星人的屏保
发表于 2008-12-30 00:53:12 | 显示全部楼层
我不知道我能否看见那一天……
 楼主| 发表于 2008-12-30 00:54:54 | 显示全部楼层
论坛里很多项目啊。。。。。。
外星人那个比较神奇。。。。。
发表于 2008-12-30 00:56:59 | 显示全部楼层
这种药就算弄出来也是帮人赚钱,还是去找外星人吧……
发表于 2008-12-30 00:59:49 | 显示全部楼层
可惜,我的晶片组并不支援,8800作模板基盘制成的外接多向双XGT1820工程测试用显示卡没有必要档案,立马就出错了
发表于 2008-12-30 10:46:43 | 显示全部楼层
这个以前有人发过了。。。
发表于 2008-12-30 10:57:55 | 显示全部楼层
红叉不错

手续有点麻烦
发表于 2008-12-30 11:49:12 | 显示全部楼层
人家还用PS3计算黑洞呢?
发表于 2008-12-30 11:52:27 | 显示全部楼层
引用第8楼sanwell于2008-12-30 11:49发表的  :
人家还用PS3计算黑洞呢?
那是凶箱
发表于 2008-12-30 23:43:51 | 显示全部楼层
唉...protein folding..这样一点一点的计算, 不知要到什么时候
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